巴南区矿产资源分带较明显，分布相对集中，主要分布在区内三大背斜附近，包括南温泉地热成矿带，桃子荡石灰岩、地热、铁矿成矿带，丰盛场石灰岩、煤、地热成矿带等3个成矿区带。在重庆市范围内，巴南区属矿产资源相对较少的区县之一，但具有地热、石灰岩（水泥用灰岩、建筑石料用灰岩）和砖瓦用页岩等特色优势矿产，具有找矿潜力的矿产主要是石英砂（玻璃用砂、建筑用砂）、煤和铁矿。全区共发现矿产20种（含亚矿种），查明矿产资源储量17种。辖区内能源矿产、金属矿产较少；非金属矿产中水泥用灰岩、建筑石料用灰岩、砖瓦用页岩资源丰富；地热资源在全市具有得天独厚的优势；石英砂（玻璃用砂、建筑用砂）、煤、铁矿等具有一定的资源潜力。